珍稀濒危树种毛红椿微卫星DNA分离及SSR反应体系优化

被引：22

作者：

刘军 ^{[1
]}

孙宗修 ^{[2
]}

陈益泰 ^{[1
]}

何贵平 ^{[1
]}

吴天林 ^{[1
]}

机构：

[1] 中国林业科学院亚热带林业研究所

[2] 中国水稻研究所水稻生物学国家重点实验室

来源：

中国生物工程杂志 | 2006年 / 12期

关键词：

毛红椿; 微卫星; 链亲和素磁珠; SSR反应体系;

D O I：

10.13523/j.cb.20061210

中图分类号：

S792.99 [其他];

学科分类号：

0829 ; 0907 ;

摘要：

以江西宜丰种源毛红椿为材料,成功提取其基因组DNA。利用改良的链亲和素磁珠法亲和捕捉出毛红椿基因组微卫星DNA片段,并构建了富含微卫星的基因组文库。从构建的基因组文库中随机挑选了63个单克隆进行测序,其中50个单克隆成功测序,含有微卫星的单克隆有18个,并根据测序结果设计并合成SSR引物18对。利用所合成的引物优化SSR反应体系,对影响SSR反应的各个因子进行了探讨。确定了模板DNA最适浓度为30ng;dNTP的最适浓度为0.3mmol/L;0.3μmol/L是引物在反应体系中的最合适浓度。建立了重复性好、稳定性好的SSR反应体系,为下一步进行毛红椿群体遗传结构和遗传变异研究提供了技术支持。

引用

页码：50 / 55

页数：6

共 14 条

[11]

Tarnello egies for microsatellite isolation:a review. Zane L,Bargellonit L. Molecular Ecology . 2002

[12]

Microsatellites from molecules to populations and back. Jarne P,Lagoda P J L. Trends in Ecology and Evolution . 1996

[13]

Microsatellite DNA in Actinidia chinensis: isolation, characterisation, and homology in related species[J] . W.-G. Huang,G. Cipriani,M. Morgante,R. Testolin. &nbspTAG Theoretical and Applied Genetics . 1998 (8)

[14] 林木基因组中的微卫星(SSR)及其应用 [J].

李新军 ;

黄敏仁 ;

潘惠新 ;

王明庥 .

南京林业大学学报, 1999, (05) :64-69

← 1 2 →