基于网络药理学和分子对接分析痛泻要方治疗肠炎相关结直肠癌机制研究

被引:4
作者
闫思超 [1 ,2 ,3 ]
潘国凤 [1 ]
机构
[1] 首都医科大学附属北京世纪坛医院
[2] 临床合理用药评价北京市重点实验室
[3] 临床合理用药生物特征谱学评价国际合作联合实验室
关键词
肠炎相关结肠直肠癌; 痛泻要方; 炎症性肠病; 炎癌转化; 网络药理学;
D O I
10.13194/j.issn.1673-842x.2022.07.042
中图分类号
R285.6 [中药临床药理];
学科分类号
100806 [中药药理学];
摘要
目的 基于网络药理学分析中药经典复方痛泻要方的活性成分、靶点和信号通路,并探索痛泻要方治疗结肠炎相关结肠直肠癌(CaCRC)的潜在分子机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP),获得痛泻要方的主要化合物及其靶点,利用Cytoscape3.8.2绘制痛泻要方“药物-活性成分-靶点”网络图。采用GeneCards数据库搜索与CaCRC疾病相关基因,对痛泻要方中药物对应的潜在靶点与CaCRC致病基因取共同部分,作为痛泻要方的预测靶点。采用DAVID数据库对痛泻要方治疗CaCRC的预测靶点进行基因本体(GO)功能富集、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。基于STRING数据库构建靶蛋白相互作用(PPI)网络图。利用中医药整合药理学研究平台V2.0(TCMIP V2.0)对作用于PPI网络中核心靶点的中药活性成分进行吸收、分配、代谢、排泄和毒性(ADMET)水平分析。通过Python脚本和AutoDock Vina软件将ADMET分析得到的吸收水平较好的活性化合物与PPI分析获得的关键靶点进行分子对接,并计算结合能。结果 项目收集到痛泻要方中4味中药的40个化学成分和145个靶标信息,并获得了3184个疾病靶标,将药物和疾病靶标取交集获得101个核心靶标,其中TP53、AKT1、CCND1等基因与CaCRC相关性较强。对核心靶标进行GO和KEGG分析结果显示,这些靶标主要富集于对无机物的反应、细胞对有机环状化合物的反应、MAPK级联激活过程和乙型肝炎、流体剪切力和动脉粥样硬化、前列腺癌等生物过程。PPI网络分析结果显示痛泻要方治疗CaCRC的关键靶点主要包括纤维连接蛋白1(FN1)、细胞周期蛋白D1(CCND1)、CAMP反应元件结合蛋白1(CREB1)等。对痛泻要方中作用于关键靶点的活性成分进行ADMET分析,结果显示痛泻要方中的川皮苷、柚皮素、5-O-甲基维斯阿米醇等成分吸收水平较好。分子对接中川皮苷、柚皮素、汉黄芩素、地黄酚和5-O-甲基维斯阿米醇与FN1、RELA、CCND1、GSK3B、AR的结合能均小于≤-5.0 kJ/mol,展现出较好的亲和力。结论 痛泻要方中主要化学成分可能通过调节对无机物的反应、细胞对有机环状化合物的反应、MAPK级联激活过程等改善CaCRC。复方中主要活性成分川皮苷、柚皮素、汉黄芩素、地黄酚和5-O-甲基维斯阿米醇与关键靶点FN1、RELA、CCND1、GSK3B、AR结合可能是其发挥作用的重要机制。
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