基于RAPD和EST-SSR标记的秀珍菇菌株聚类分析

被引：15

作者：

忻雅

阮松林

王世恒

马华升

王伟科

王淑珍

机构：

[1] 杭州市农业科学研究院

来源：

食用菌学报 | 2008年 / 15卷 / 04期

关键词：

秀珍菇; RAPD标记; EST-SSR标记; 聚类分析;

D O I：

10.16488/j.cnki.1005-9873.2008.04.009

中图分类号：

S646.1 [褶伞菌];

学科分类号：

090202 ;

摘要：

本研究利用RAPD标记和EST-SSR标记对10个不同来源的秀珍菇菌株进行聚类分析。200条RAPD引物中127条有扩增产物。引物可用率为63.5%。从NCBI数据库中下载秀珍菇及相近侧耳属食用菌EST序列2167条,聚类比对后得到全长为713.541 kb的非冗余EST 1442条,搜寻后得到的29个EST-SSR全部设计引物,其中26对引物(89.7%)显示多态性。根据17条RAPD核心引物和10对EST-SSR核心引物的扩增结果,对10个秀珍菇菌株进行了RAPD标记、EST-SSR标记及二者相结合的聚类分析。3种分析结果相近,且与菌丝、子实体生长特性分析结果相统一—10个供试菌株区分为5组:1～4号菌株为一组,6号和7号菌株为一组,8号和9号菌株为一组,5号和10号菌株各自为一组。

引用

页码：20 / 25

页数：6

共 9 条

[1]

10个秀珍菇菌株的品比试验[J]. 王伟科,周祖法,袁卫东,闫静,陆娜.杭州农业科技. 2007(05)

[2]

10个秀珍菇菌株的品比试验[J]. 王伟科,周祖法,袁卫东,闫静,陆娜.杭州农业科技. 2007 (05)

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