应用SSR标记分析鹰嘴豆种质资源遗传多样性

被引：9

作者：

张金波

苗昊翠

王威

肖菁

李利民

机构：

[1] 新疆农业科学院农作物品种资源研究所

来源：

植物遗传资源学报 | 2015年 / 16卷 / 05期

关键词：

鹰嘴豆; 种质资源; SSR; 遗传多样性; 聚类分析;

D O I：

10.13430/j.cnki.jpgr.2015.05.014

中图分类号：

S529 [其他];

学科分类号：

090104 [作物信息科学与技术];

摘要：

种质资源的遗传多样性是育种工作的基础,本研究利用SSR标记对鹰嘴豆资源进行遗传多样性分析,旨在发掘鹰嘴豆资源中丰富的遗传变异。从48对鹰嘴豆SSR引物中筛选出18对核心多态性引物,对96份不同来源的鹰嘴豆种质资源进行SSR标记的遗传多样性分析。结果表明,18对SSR引物共检测到115个等位变异,占总检测位点的52.99%,每对SSR引物可检测出3～10个等位变异,平均6.39个;平均每个位点多态信息量(PIC)为0.8107,变化范围为0.6661～0.8984。Shannon's信息指数平均为1.4769,变化范围为0.0607～1.9584。PGMA聚类结果表明,在遗传相似系数0.59处,可将96份鹰嘴豆资源分为6个类群,类群Ⅰ包含9份资源,类群Ⅱ包含2份资源,类群Ⅲ包含28份资源,类群Ⅳ包含4份资源,类群Ⅴ包含40份资源,类群Ⅵ包含13份资源。本研究对我国鹰嘴豆种质资源的评价与利用、优异基因的挖掘、育种亲本材料的选择等提供科学依据。

引用

页码：1027 / 1034

页数：8

共 16 条

[1]

鹰嘴豆种质资源主要农艺性状遗传多样性研究 [J].

张金波 ;

李利民 ;

苗昊翠 ;

王威 ;

肖菁 ;

热依拉 .

新疆农业科学, 2014, 51 (01) :110-117

[2]

鹰嘴豆种质资源对Ascochyta rabiei的抗性评价及遗传多态性分析 [J].

马丽娟 ;

张巨松 ;

李利民 ;

陈晓露 ;

曾繁明 ;

杨忠芳 ;

羌松 .

植物遗传资源学报, 2013, 14 (06) :1179-1184

[3]

鹰嘴豆黄酮对大鼠高血脂症形成过程中脂代谢的干预作用 [J].

郑玲玲 ;

裴凌鹏 .

中国民族医药杂志, 2011, 17 (03) :39-42

[4]

鹰嘴豆提取物对2型糖尿病大鼠糖、脂代谢的影响 [J].

何雯 ;

李郁 ;

吴发宝 ;

闫冬 ;

程路峰 ;

帕尔哈提克热木 .

新疆医科大学学报, 2011, 34 (02) :168-171

[5]

Genetic dissection of drought tolerance in chickpea (Cicer arietinum L.) [J].

Varshney, Rajeev K. ;

Thudi, Mahendar ;

Nayak, Spurthi N. ;

Gaur, Pooran M. ;

Kashiwagi, Junichi ;

Krishnamurthy, Lakshmanan ;

Jaganathan, Deepa ;

Koppolu, Jahnavi ;

Bohra, Abhishek ;

Tripathi, Shailesh ;

Rathore, Abhishek ;

Jukanti, Aravind K. ;

Jayalakshmi, Veera ;

Vemula, Anilkumar ;

Singh, S. J. ;

Yasin, Mohammad ;

Sheshshayee, M. S. ;

Viswanatha, K. P. .

THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 2014, 127 (02) :445-462

[6]

A draft genome sequence of the pulse crop chickpea (Cicer arietinumL.) [J].

Jain, Mukesh ;

Misra, Gopal ;

Patel, Ravi K. ;

Priya, Pushp ;

Jhanwar, Shalu ;

Khan, Aamir W. ;

Shah, Niraj ;

Singh, Vikas K. ;

Garg, Rohini ;

Jeena, Ganga ;

Yadav, Manju ;

Kant, Chandra ;

Sharma, Priyanka ;

Yadav, Gitanjali ;

Bhatia, Sabhyata ;

Tyagi, Akhilesh K. ;

Chattopadhyay, Debasis .

PLANT JOURNAL, 2013, 74 (05) :715-729

[7]

Characterization of Italian chickpea (Cicer arietinum L.) germplasm by multidisciplinary approach [J].

Zaccardelli, Massimo ;

Sonnante, Gabriella ;

Lupo, Francesco ;

Piergiovanni, Angela Rosa ;

Laghetti, Gaetano ;

Sparvoli, Francesca ;

Lioi, Lucia .

GENETIC RESOURCES AND CROP EVOLUTION, 2013, 60 (03) :865-877

[8]

Nutritional quality and health benefits of chickpea ( Cicer arietinum L.): a review.[J].A. K. Jukanti;P. M. Gaur;C. L. L. Gowda;R. N. Chibbar.British Journal of Nutrition.2012, S1

[9]

Integration of novel SSR and gene-based SNP marker loci in the chickpea genetic map and establishment of new anchor points with Medicago truncatula genome [J].

Nayak, Spurthi N. ;

Zhu, Hongyan ;

Varghese, Nicy ;

Datta, Subhojit ;

Choi, Hong-Kyu ;

Horres, Ralf ;

Juengling, Ruth ;

Singh, Jagbir ;

Kishor, P. B. Kavi ;

Sivaramakrishnan, S. ;

Hoisington, Dave A. ;

Kahl, Guenter ;

Winter, Peter ;

Cook, Douglas R. ;

Varshney, Rajeev K. .

THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 2010, 120 (07) :1415-1441

[10]

Characterization of a chickpea ( Cicer arietinum L.) NAC family gene; CarNAC5 ; which is both developmentally- and stress-regulated.[J].Hui Peng;Hui-Ying Cheng;Xin-Wang Yu;Qing-Hua Shi;Hua Zhang;Jian-Gui Li;Hao Ma.Plant Physiology and Biochemistry.2009, 11

← 1 2 →