滇东南水牛线粒体DNA控制区遗传多样性分析

被引:4
作者
张自芳 [1 ]
刘丽仙 [1 ]
钱林东 [1 ]
李卓然 [2 ]
陆润峰 [3 ]
侬胜虎 [4 ]
李大林 [5 ]
苗永旺 [2 ]
机构
[1] 云南农业职业技术学院畜牧兽医系
[2] 云南农业大学动物科学技术学院
[3] 云南省广南县畜牧兽医局
[4] 云南省广南县畜牧技术推广站
[5] 云南巴福乐水牛技术研究所
关键词
滇东南水牛; mtDNA D-loop; 遗传多态性; 遗传分化;
D O I
暂无
中图分类号
S823.83 [];
学科分类号
0905 ;
摘要
为了从母系遗传角度阐明滇东南水牛的群体遗传特征,本文采用PCR产物直接测序的方法对随机采集的35头滇东南水牛样品的线粒体DNA控制区序列进行了检测,并结合已发表的数据对所得序列进行了群体遗传和系统发育分析。结果在滇东南水牛中共检测到47个核苷酸多态位点,其中单一变异位点8个,简约信息位点39个,共定义了17种单倍型。在所分析的滇东南水牛序列中,碱基T,C,A和G的平均含量分别为28.0%,25.5%,31.7%,14.8%,单倍型多样度为0.815±0.066,核苷酸多样度为0.011 34±0.003 06,序列间平均核苷酸差异数是9.926,群体内遗传距离为0.011±0.002。系统发育和遗传差异分析显示:滇东南水牛与河流型水牛存在较大差异,检测的所有个体均属于沼泽型水牛mtDNA世系,但其由A和B两个支系组成,B支系又可进一步分为B1和B2两个亚支系。结果表明,滇东南水牛mtDNA遗传多样性较低,其存在两个母系血统来源,受河流型水牛基因渗入较小。
引用
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