中国水牛mtDNA D-loop区遗传多样性与母系起源

被引:11
作者
谢文美 [1 ,2 ]
苏锐 [2 ]
张晓明 [2 ]
张云生 [2 ]
王小斌 [2 ]
雷初朝 [2 ]
机构
[1] 平凉医学高等专科学校
[2] 西北农林科技大学动物科技学院
关键词
水牛; mtDNA D-loop; 遗传多样性; 单倍型; 支系; 起源;
D O I
暂无
中图分类号
S823.2 [];
学科分类号
090501 ;
摘要
[目的]检测中国水牛21个群体232条线粒体DNA D-loop 915 bp全序列的遗传多样性及系统进化关系。[方法]PCR扩增、测序和生物信息学方法。[结果]发现232条序列中共有87种单倍型,其核苷酸多态位点88个,其中有79个转换,6个颠换,3个颠换与转换共存。中国水牛mtDNA D-loop区核苷酸多样度(π值)为0.01403±0.00178,单倍型多样度(H)为0.8460±0.0240,表明中国水牛mtDNA遗传多样性丰富。根据单倍型构建了中国水牛的NJ分子系统树,发现中国水牛变异类型主要为两个大支系A和B,表明中国水牛有两个主要母系起源。进一步分析发现支系B具有较大的差异,可以细分为两个亚支B1和B2。[结论]中国水牛mtDNA遗传多样性丰富,有2个母系起源。
引用
收藏
页码:3 / 7
页数:5
相关论文
共 6 条
[1]   中国部分地方水牛品种mtDNA D-loop区遗传多样性与起源研究 [J].
齐国强 ;
昝林森 ;
张桂香 ;
王志刚 ;
王均辉 ;
韩旭 .
畜牧兽医学报, 2008, (01) :7-11
[2]   8个亚洲水牛群体的遗传结构分析 [J].
王冬蕾 ;
常洪 ;
杨军香 ;
张桂香 ;
王志刚 ;
于波 ;
廖信军 ;
宋卫涛 ;
韩旭 ;
宋光明 ;
王均辉 ;
李荣岭 .
遗传, 2007, (09) :1103-1109
[3]   温州水牛线粒体DNA D-loop遗传多态性分析 [J].
刘若余 ;
张伟 ;
金大春 ;
陈宏 ;
雷初朝 .
中国牛业科学, 2007, (01) :1-3
[4]   长江流域水牛血液蛋白多态性研究 [J].
史荣仙 ;
付茂忠 ;
赖松家 ;
左福元 ;
董学虎 ;
高蓉 ;
吴东江 ;
陈润文 ;
李克勇 ;
赵廷述 ;
余超群 ;
黄铁夫 ;
蒋长宇 .
遗传, 1995, (01) :7-11
[5]   Independent maternal origin of Chinese swamp buffalo (Bubalus bubalis) [J].
Lei, C. Z. ;
Zhang, W. ;
Chen, H. ;
Lu, F. ;
Liu, R. Y. ;
Yang, X. Y. ;
Zhang, H. C. ;
Liu, Z. G. ;
Yao, L. B. ;
Lu, Z. F. ;
Zhao, Z. L. .
ANIMAL GENETICS, 2007, 38 (02) :97-102
[6]  
Polymorphism of Mitochondrial DNAs of Yunnan Domestic Water Buffaloes, Bubalus bubalis, in China, Based on Restriction Endonuclease Cleavage Patterns[J] . Wenping Hu,Baoming Xu,Linsheng Lian.Biochemical Genetics . 1997 (7)