荔枝SSR标记的研究

被引:20
作者
李明芳
郑学勤
机构
[1] 中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室,中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室海口,海口
关键词
荔枝; SSR标记; SAM法; 种质;
D O I
10.16288/j.yczz.2004.06.027
中图分类号
S667.1 [荔枝];
学科分类号
090201 ;
摘要
以无核荔枝A4号为实验材料 ,应用选择性扩增微卫星 (SAM)法分离、克隆了 10 0个简单序列重复 (SSR)序列 ,其中 88个非重复 ,可用。加上搜索数据库所获得的 1个SSR序列 ,一共 89个序列用于特异引物的设计。仅从71个序列的 82个基因座设计出特异引物。合成 4 1条特异引物 (与 5′锚定简并引物配对 ,个别相互配对 ) ,对其中的 39个基因座进行检测。其中 15对引物扩增出相应大小的片段 ,另外 11对引物扩增出非预期片段。最后 ,以 37个荔枝种质的基因组DNA为模板 ,从 2 6对出带的引物中 ,筛选出多态性引物 2 1对 ,获得了 2 2个荔枝基因座特异性SSR标记
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