北极太平洋扇区海洋沉积物细菌多样性的系统发育分析

被引：20

作者：

李会荣 ^{[1
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俞勇 ^{[1
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曾胤新 ^{[1
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陈波 ^{[1
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任大明 ^{[2
]}

机构：

[1] 国家海洋局极地科学重点实验室中国极地研究中心

[2] 复旦大学遗传学研究所遗传工程国家重点实验室

来源：

微生物学报 | 2006年 / 02期

关键词：

北极太平洋扇区; 沉积物; 细菌; 系统发育;

D O I：

10.13343/j.cnki.wsxb.2006.02.003

中图分类号：

Q931 [微生物的演化（适应与变异）];

学科分类号：

摘要：

对北极太平洋扇区3个不同深度的海洋沉积物样品,采用PCR结合变性梯度凝胶电泳（DGGE）技术进行细菌16S rRNA基因V3区序列的系统发育分析。结果表明,同一个沉积物样品不同层次的DGGE电泳图谱不完全相同。从3个沉积物样品中共获得50条序列,大部分序列与从海洋环境尤其海洋沉积物获得的细菌16S rDNA序列相似性较高（88%100%）,归属于变形细菌（Proteobacteria）的gamma亚群、alpha亚群、beta亚群、epsilon亚群、delta亚群,CytophagaFlavobacteriumBacteroides（CFB）群细菌和高G+C含量的革兰氏阳性细菌等系统分类群,其中变形细菌（Proteobacteria）的gamma亚群为沉积物中的优势细菌类群。

引用

页码：177 / 183

页数：7

共 8 条

[1] 太平洋帕里西维拉海盆细菌多样性的非培养的初步分析 [J].