不同居群栽培牡丹rDNA ITS区序列分析及鉴别

被引:4
作者
徐纲 [1 ]
于超 [1 ]
阳勇 [2 ]
杨俊艳 [3 ]
机构
[1] 重庆医科大学生命科学研究院
[2] 重庆市中药研究院
[3] 重庆医科大学附属口腔医院
关键词
牡丹; rDNA ITS; 单核苷酸多态性; 分子标记;
D O I
10.16333/j.1001-6880.2009.02.016
中图分类号
S567.15 [];
学科分类号
摘要
对我国四个地区牡丹主要栽培品种rDNA ITS区序列进行测定,研究各居群rDNA ITS序列特征及差异,建立不同地区主要牡丹栽培品种的区域性分子标记,参照GeneBank信息(登录号:U27692)利用Clustal X、MEGA3.1分子进化遗传分析软件对测序结果排序。牡丹ITS全序列长度为652 bp,相对于GenBank中牡丹rD-NA ITS全序列在448位少一个C碱基,其中ITS1为267 bp,5.8 S为163 bp,ITS2为222 bp,GC含量为55.7%~56.9%,共有30个变异位点,主要发生在ITS1、ITS2区,5.8S区也存在多个位点的变异。牡丹rDNA ITS区序列特征(SNPs)可用于不同地区主要牡丹栽培品种的鉴别。
引用
收藏
页码:225 / 230+266 +266
页数:7
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