石斛属植物rbcL基因序列变异和系统发育初步研究

目的探讨10种石斛植物叶绿体rbcL基因序列变异和系统发育关系。方法根据Genebank已经公布的植物rbcL基因序列设计一对引物,用于石斛rbcL基因PCR扩增。基因序列排列用Clustal X软件完成,应用Seqnconverter软件分析序列的长度、GC含量、GpC量、GCskew值等;用Mega4.1软件分析转换值、颠换值、转换/颠换比;采用最大简约法（maximum parsimony method）获得最大简约系统树;应用自展法（bootstrap）检验系统树,自展次数为1000次。结果10种石斛植物叶绿体rbcL基因的长度范围为944～950bp,其中536bp为保守位点,466bp为变异位点,439bp为具有系统发育信息的信息位点。基因中GC含量为40.61%41.37%,GpC含量为4.03%4.78%,GCskew值为0.0432～0.0821。序列转换/颠换比（Si/Sv）为0.9。结论利用PCR和核酸测序方法可以获得rbcL基因的核苷酸序列,能为石斛植物的系统发育研究提供核苷酸序列方面的资料。