4种鳕鱼线粒体16S rRNA、COI和Cyt b基因片段序列的比较研究

被引:50
作者
毕潇潇 [1 ]
高天翔 [1 ]
肖永双 [1 ]
李永振 [2 ]
机构
[1] 中国海洋大学海水养殖教育部重点实验室
[2] 中国水产科学研究院南海水产研究所
基金
国家高技术研究发展计划(863计划);
关键词
鳕鱼; 16S rRNA基因; COI基因; Cyt b基因; 序列分析;
D O I
暂无
中图分类号
S917.4 [水产动物学];
学科分类号
摘要
对狭鳕(Theragra chalcogramma)、太平洋鳕(Gadus macrocephalus)、蓝鳕(Micromesistius poutassou)和远东宽突鳕(Eleginus gracilis)4种不同属鳕鱼的线粒体16S rRNA、Cytochrome oxidase subunit I(COI)和细胞色素b(Cytb)基因片段序列进行了测定,分析比较了不同鳕鱼种间的序列差异。通过PCR扩增和序列测定,得到4种鳕鱼线粒体3个基因片段的总长度分别为539bp(16S rRNA)、601bp(COI)和385bp(Cytb),其基因片段的A+T含量都较高。4种鳕鱼种内个体间序列变异较小,3个基因片段的核苷酸替代速率依次为Cytb>COI>16S rRNA。Cytb基因片段序列的分析结果显示太平洋鳕和狭鳕间分歧时间约为219万年,发生于中新世(Mio-cene);宽突鳕与蓝鳕间分歧时间约为653万年,发生在上新世(Pliocene)。根据遗传距离构建的NJ系统树表明,狭鳕与太平洋鳕的亲缘关系较近,与蓝鳕的亲缘关系较远。
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