低密度cDNA芯片技术的优化

被引：2

作者：

赵雨杰

黄宝俊

徐惠绵

何群

机构：

[1] 中国医科大学生物芯片中心

[2] 中国医科大学附属第一医院肿瘤外科

[3] 中国医科大学生物芯片中心中国辽宁沈阳

[4] 中国辽宁沈阳

来源：

生命科学研究 | 2004年 / 04期

关键词：

cDNA芯片; 靶基因长度和浓度; 点样溶液; 杂交动力学; 可靠性;

D O I：

10.16605/j.cnki.1007-7847.2004.04.006

中图分类号：

Q7 [分子生物学];

学科分类号：

071010 ;

摘要：

为了建立稳定的低密度cDNA芯片技术平台,研究靶基因的最适长度、浓度、点样溶液种类及杂交反应动力学,并了解该芯片的重复性与可靠性.结果表明,杂交具有较好的特异性,不同长度(189～1078bp)、浓度(0.5g/L、1.0g/L、1.5g/L)的同一靶基因杂交信号强度无明显差别;以50%DMSO为点样溶液者杂交信号最好(P=0.0001).60℃杂交18h信号最佳(P<0.001).重复2次检测结果差异无显著性(P=0.348),重复性较好,其相关系数为0.588.与RT-PCR结果相比,相关系数为-0.778(P<0.0001),特异性为100%,灵敏度为80%(16/20),可靠性较好.

引用

页码：322 / 328

页数：7

共 5 条

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