珠海市2013年手足口病患儿柯萨奇病毒A2型分离株基因特征分析

目的分析2013年珠海市手足口病患儿柯萨奇病毒A2（CV-A2）5′UTR-VP4-VP2区基因特征,探讨其与国内外其他地区CV-A2分离株的关系。方法采集2013年珠海市手足口病患儿粪便标本,提取病毒RNA,用半巢式RT-PCR方法扩增5′UTR-VP4-VP2区,通过测序和Blast比对确定病毒型别,并利用DNAStar软件和MEGA4.1软件分别对珠海市CV-A2分离株进行核苷酸序列分析和遗传进化树分析。结果共鉴定出4株CV-A2,核苷酸序列分析表明CV-A2珠海株与2012年中国香港株在5′UTR-VP4-VP2区有最高的同源性,达97.4%98.2%;进化树分析显示4株CV-A2珠海株与2012年中国香港株共同构成A进化树分支,Bootstrap值为99%。结论珠海市4株CV-A2与2012年中国香港株在5′UTR-VP4-VP2区具有较高的同源性,且进化关系密切。