Rim2因子超级家族的分布及分子指纹技术在水稻品种鉴定中的应用

被引：2

作者：

王建军 ^{[1
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王林友 ^{[1
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田平芳 ^{[2
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张礼霞 ^{[1
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张利华 ^{[1
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余庆生 ^{[1
]}

何祖华 ^{[2
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机构：

[1] 浙江省农业科学院作物与核技术利用研究所

[2] 中国科学院上海生命科学院植物生理生态研究所

来源：

农业生物技术学报 | 2006年 / 01期

关键词：

Oryzasativa; Rim2超级基因家族; 基因分布; 指纹; 纯度鉴定;

D O I：

暂无

中图分类号：

S511 [稻];

学科分类号：

摘要：

通过GenBank中230Mb水稻序列的对比分析,新鉴定的水稻Rim2因子家族编码亚组和假基因亚组不均匀地分布于12条染色体上,以着丝点区域分布频率为最高。由基因内缺失和插入使得Rim2因子序列多变,结合其众多的拷贝数尝试将其开发为一新的分子指纹。以水稻(Oryzasativassp.indica)品种R963及其育种亲缘材料为测试样本,尽管材料间可能存在极其相近的遗传背景,利用Rim2因子设计的5个引物,还是检测出材料间DNA水平的差异。采用同样引物,对2份杂交籼稻(O.sativassp.indica)和1份杂交粳稻(O.sativassp.japonica)组合及相应亲本的PCR检测,获得所有材料的特异指纹。Rim2因子可作为水稻品种鉴别的分子指纹,也可应用于杂交稻纯度的快速鉴定。

引用

页码：65 / 69

页数：5

共 4 条

[1] 病原菌诱导转录的水稻Rim2家族转座酶编码亚组的结构与分布 [J].

田平芳 ;

王国栋 ;

吴刚 ;

李群 ;

罗利军 ;

李德葆 ;

何祖华 .

植物生理与分子生物学学报, 2003, (03) :257-264

[2]

The rice Rim2 transcript accumulates in response to Magnaporthe grisea and its predicted protein product shares similarity with TNP2-like proteins encoded by CACTA transposons[J] . Z.-H. He,H.-T. Dong,J.-X. Dong,D.-B. Li,P. C. Ronald.Molecular and General Genetics . 2000 (1-2)

[3]

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