基于网络药理学及分子对接技术探讨追风透骨胶囊对类风湿关节炎和骨关节炎“异病同治”的潜在分子机制

被引:12
作者
沈浮 [1 ]
沈乐乐 [2 ]
卢敏 [3 ]
卢芳国 [4 ]
邝高艳 [3 ]
吴泳蓉 [3 ]
赵昱东 [5 ]
夏雨 [1 ]
邓博 [3 ]
机构
[1] 湖南中医药大学研究生院
[2] 宁夏医科大学研究生院
[3] 湖南中医药大学第一附属医院
[4] 湖南中医药大学医学院
[5] 成都中医药大学研究生院
关键词
追风透骨胶囊; 网络药理学; 分子对接; 异病同治; 骨关节炎; 类风湿关节炎;
D O I
暂无
中图分类号
R285.5 [中药实验药理];
学科分类号
100806 [中药药理学];
摘要
目的利用网络药理学方法及分子对接的方法预测追风透骨胶囊治疗类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,RA)及骨关节炎(osteoarthritis,OA)的活性成分、作用靶点及相关生物学途径,丰富其异病同治的科学内涵。方法利用TCMSP、BATMAN-TCM数据库筛选出追风透骨胶囊的活性成分及治疗RA及OA的对应靶点,采用Cytoscape 3.7.0软件构建"药物-化合物-共有靶标"网络图,运用STRING平台构建靶蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,运用R语言数据包进行基因本体功能富集(gene ontology,GO)与京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomics,KEGG)富集分析,预测其作用机制,最后对追风透骨胶囊中的关键活性化合物与PPI中的核心蛋白进行分子对接验证。结果追风透骨胶囊共筛选有效活性成分276种,涉及共同靶标207个。"药物-化合物-共有靶标"网络图中筛选出关键活性化合物12个,其干预的PPI网络主要涉及STAT3、AKT1、APP等核心蛋白,共有靶标的GO及KEGG富集分析结果主要涉及代谢、炎性反应、肿瘤等相关通路及多种生物学途径。分子对接验证提示β-谷甾醇与核心靶蛋白结合情况最佳,HSP90AA1是追风透骨胶囊中关键化学成分结合活性最优的靶蛋白。结论追风透骨胶囊中槲皮素、木犀草素、山奈酚等12种关键有效活性成分作用于STAT3、AKT1、APP等12种核心靶蛋白发挥干预OA、RA的药理作用并涉及多种生物学途径,阐释了追风透骨胶囊对OA以及RA异病同治的分子基础。
引用
收藏
页码:3526 / 3537
页数:12
相关论文
共 35 条
[31]
RNAi knockdown of the Akt1 gene increases the chemosensitivity of gastric cancer cells to cisplatin both in vitro and in vivo[J] Wei Zhou;Xue-Qiong Fu;Jie Liu;Hong-Gang Yu Regulatory Peptides 2012,
[32]
β-Sitosterol down-regulates some pro-inflammatory signal transduction pathways by increasing the activity of tyrosine phosphatase SHP-1 in J774A.1 murine macrophages[J] Michael Valerio;Atif B. Awad International Immunopharmacology 2011,
[33]
Surflex-Dock 2.1: Robust performance from ligand energetic modeling; ring flexibility; and knowledge-based search[J] Ajay N. Jain Journal of Computer-Aided Molecular Design 2007,
[34]
A network pharmacology study on the active ingredients and potential targets of Tripterygium wilfordii Hook for treatment of rheumatoid arthritis HU W;FU W;WEI X;et al; Evid Based Complement Alternat Med 2019,
[35]
Implications of angiogenesis involvement in arthritis Macdonald IJ;Liu SC;Su CM.et al; Int J Mol Sci 2018,