植物DNA条形码促进系统发育群落生态学发展

被引:17
作者
裴男才 [1 ,2 ]
张金龙 [3 ,2 ]
米湘成 [3 ]
葛学军 [1 ]
机构
[1] 中国科学院华南植物园中国科学院植物资源保护与可持续利用重点实验室
[2] 中国科学院研究生院
[3] 中国科学院植物研究所植被与环境变化国家重点实验室
关键词
群落系统发育重建; 群落生态学; rbcL,matK,trnH-psbA; 大型固定样地; APG分类系统;
D O I
暂无
中图分类号
Q948 [植物生态学和植物地理学];
学科分类号
071012 ; 0713 ;
摘要
系统发育群落生态学是近年兴起的一个重要生态学研究分支,它以群落生态学为基础并引入了系统发育的分析方法,全面动态地反映了群落中物种内和物种间的相互作用关系,揭示了群落格局形成的生态学过程,研究了生物多样性的形成及维持机制。巴拿马BCI(Barro Colorado Island)样地的成功例子说明,在固定样地进行长期的群落生态与系统发育研究切实可行且极具意义;DNA条形码的快速兴起对这一研究发挥着重要作用。本文先列举了群落生态与系统发育综合分析能解决的群落系统发育结构、群落生态位结构、生物地理学和性状进化等生态学问题;接着介绍了标准植物DNA条形码以及利用片段组合(rbcL+matK+trnH-psbA)进行快速物种识别和近缘种区分、精确群落系统发育关系的构建以及群落生态学研究;随后提出DNA条形码研究在类群水平上需注意两片段的条形码组合(matK+rbcL)在同属种鉴别能力上的不足,而在较大尺度群落水平上需对实验设计进行优化。DNA条形码将为探讨物种多样性及其维持机理、系统发育beta多样性以及群落水平上功能性状进化研究提供新的思路。
引用
收藏
页码:284 / 294+388 +388-389
页数:13
相关论文
共 83 条
[1]  
NICHE EVOLUTION AND ADAPTIVE RADIATION: TESTING THE ORDER OF TRAIT DIVERGENCE[J] . D. D. Ackerly,D. W. Schwilk,C. O. Webb. &nbspEcology . 2006 (sp7)
[2]  
TOLERANCE TO SHADE, DROUGHT, AND WATERLOGGING OF TEMPERATE NORTHERN HEMISPHERE TREES AND SHRUBS[J] . ülo Niinemets,Fernando Valladares. &nbspEcological Monographs . 2006 (4)
[3]   A proposal for a standardised protocol to barcode all land plants [J].
Chase, Mark W. ;
Cowan, Robyn S. ;
Hollingsworth, Peter M. ;
van den Berg, Cassio ;
Madrinan, Santiago ;
Petersen, Gitte ;
Seberg, Ole ;
Jorgsensen, Tina ;
Cameron, Kenneth M. ;
Carine, Mark ;
Pedersen, Niklas ;
Hedderson, Terry A. J. ;
Conrad, Ferozah ;
Salazar, Gerardo A. ;
Richardson, James E. ;
Hollingsworth, Michelle L. ;
Barraclough, Timothy G. ;
Kelly, Laura ;
Wilkinson, Mike .
TAXON, 2007, 56 (02) :295-299
[4]   An emerging synthesis between community ecology and evolutionary biology [J].
Johnson, Marc T. J. ;
Stinchcombe, John R. .
TRENDS IN ECOLOGY & EVOLUTION, 2007, 22 (05) :250-257
[5]  
Phylogenetic beta diversity: linking ecological and evolutionary processes across space in time[J] . Catherine H.Graham,Paul V. A.Fine. &nbspEcology Letters . 2008 (12)
[6]  
Shade Tolerance, a Key Plant Feature of Complex Nature and Consequences[J] . Fernando Valladares,ülo Niinemets. &nbspAnnual Review of Ecology, Evolution, and Systematics . 2008
[7]   Dissecting Tropical Plant Diversity with Forest Plots and a Molecular Toolkit [J].
Dick, Christopher W. ;
Kress, W. John .
BIOSCIENCE, 2009, 59 (09) :745-755
[8]   The relationship between wood density and mortality in a global tropical forest data set [J].
Kraft, Nathan J. B. ;
Metz, Margaret R. ;
Condit, Richard S. ;
Chave, Jerome .
NEW PHYTOLOGIST, 2010, 188 (04) :1124-1136
[9]  
Functional traits and the growth–mortality trade‐off in tropical trees[J] . S. Joseph Wright,Kaoru Kitajima,Nathan J. B. Kraft,Peter B. Reich,Ian J. Wright,Daniel E. Bunker,Richard Condit,James W. Dalling,Stuart J. Davies,Sandra Díaz,Bettina M. J. Engelbrecht,Kyle E. Harms,Stephen P. Hubbell,Christian O. Marks,Maria C. Ruiz-Jaen,Cristina M. Salvador,Amy E. Zanne. &nbspEcology . 2010 (12)
[10]   植物分子系统学近五年的研究进展概况 [J].
汪小全 ;
洪德元 .
植物分类学报, 1997, (05) :465-480