10种海参16SrDNA序列多样性及其亲缘关系分析

被引：10

作者：

费来华 ^{[1
]}

李赟 ^{[1
]}

陈家鑫 ^{[2
]}

机构：

[1] 中国海洋大学

[2] 中国水产科学研究院黄海水产研究所

来源：

中国水产科学 | 2008年 / 05期

关键词：

海参; 16SrDNA; 系统发生;

D O I：

暂无

中图分类号：

S917.4 [水产动物学];

学科分类号：

摘要：

运用PCR扩增10种海参的16SrDNA部分序列,并测序。获得大小为566bp的序列,利用DNAsp4.0软件分析比较10种海参的碱基组成、各碱基变异位点数、插入或缺失位点数,并采用MEGA4.0软件分析彼此间的遗传距离。结果发现,10种海参富含AT碱基,A+T的含量平均为57.0%,不同种海参间发生碱基转换、颠换及发生插入或缺失变异的位点数差异很大,10种海参彼此间的遗传距离在0.007～0.316之间。所得结果与GenBank中10种海参的相应序列进行比对分析,同时用MEGA4.0和PAUP*4.0软件构建进化树,分析其亲缘关系。结果表明,利用16SrDNA序列的差异可以将分属于海参科(Holothuriidae)与刺参科(Stichopodidae)的海参完全分开,瓜参科(Cucumariidae)的2个种与刺参科的亲缘关系较近。对不同海参种间亲缘关系的分析结果还表明,同属于刺参科的仿刺参(Apostichopus japonicus)与加州拟刺参(Parastichopus californicus)和具疣拟刺参(Parastichopus parvimensis)亲缘关系最近,同属于海参科的格皮氏海参(Pearsonothuria graeffei)与白尼参属的蛇目白尼参(Bohadschia argus)和图纹白尼参(B.marmorata)亲缘关系最近,而同样为海参科的墨西哥海参(Holothuria mexicana)则与红腹海参(Holothuria edulis)关系最近。这些资料为海参的种质资源管理、新种引进和种质改良提供了基础的分子生物学依据。

引用

页码：755 / 765

页数：11

共 15 条

[1] 刺参种群同工酶的生化遗传分析 [J].

高悦勉 ;

孙静波 .

大连水产学院学报, 2004, (01) :30-34

[2]

Phylogeny of Holothuroidea(Echinodermata)inferred from morphology. Karr A M,Kim J. Zoological Journal of the Linnean Society . 2001

[3]

Molecularphy-logeny of eastern pacific sea cucumbers(Echinodermata:Holothuroidea)based on mitochondrial DNA sequence. Arndt A,Marquez C,Lambert P,et al. Mol Phylogen Evol . 1996

[4] 3种鲍16S rRNA基因片段序列的初步研究 [J].

杨建敏郑小东王如才宋志乐孙振兴 .

青岛海洋大学学报(自然科学版), 2003, (01) :36-40

[5] 中国对虾线粒体16SrRNA基因序列分析(英文) [J].

高天翔 ;

李健 ;

王清印 ;

刘进贤 .

中国水产科学, 2003, (05) :359-364

[6] 线粒体DNA用作分子标记的可靠性和研究前景 [J].

牛屹东 ;

李明 ;

魏辅文 ;

冯祚建 .

遗传, 2001, (06) :593-598

[7]

Molecular phylogeny of coral-reef sea cucumbers(Holothuriidae:Aspidochirotida)based on16S mitochondrial ribosomal DNA sequence. Kerr A M,Janies D A,Clouse R M,et al. Marine Biotechnology . 2005

[8]

Evolutionary genom-ics in Metasoa:the mitochondrial DNA as a model system. Saccone S,Giorgi C D,Gissi C,et a1. Gene . 1999

[9]

A revised classifi cation of the dendro-chirote holothurians. Pawson D L,Fell H B. Breviora . 1965

[10]

Phylogenetic relationships within the class Holothuroidea inferred from18S rRNA gene data. Lacey K M J,McCormack G P,Powell R,et al. Marine Biology . 2005

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