应用PCR-DGGE和Real-Time PCR分析健康与腹泻獭兔盲肠菌群

被引:4
作者
周毅 [1 ]
文斌 [2 ]
孙豪 [1 ]
段玲 [3 ]
傅祥超 [2 ]
曾东 [1 ]
倪学勤 [1 ]
汪平 [2 ]
机构
[1] 四川农业大学动物医学院
[2] 四川省草原科学研究院
[3] 西南民族大学生命科学与技术学院
关键词
腹泻; 肠道菌群; PCR-DGGE; Real-Time PCR; 獭兔;
D O I
10.13344/j.microbiol.china.150276
中图分类号
S829.1 [兔]; S852.6 [家畜微生物学(兽医病原微生物学)];
学科分类号
0905 ; 090601 ;
摘要
【目的】研究獭兔腹泻发生后盲肠菌群结构的变化情况,为微生态防治断奶兔腹泻提供理论基础。【方法】分别提取5只健康和腹泻獭兔盲肠内容物总DNA,应用PCR-DGGE及Real-Time PCR技术比较分析獭兔盲肠中菌群结构的差异。【结果】腹泻獭兔PCR-DGGE图谱条带丰富度、均匀度、多样性指数与健康獭兔相比差异均不显著,但聚类分析和主成分分析(PCA)能够将腹泻组和健康组区分开。Real-Time PCR检测显示,腹泻獭兔盲肠正常菌群普雷沃氏菌、梭菌类群Ⅰ数量与健康獭兔相比没有变化(P>0.05);链球菌属、梭菌类群Ⅳ和ⅩⅣa、白色瘤胃球菌、溶纤维丁酸弧菌、普拉梭杆菌等有益微生物数量显著降低(P<0.01),而埃希氏大肠杆菌数量却显著升高(P<0.05)。【结论】獭兔腹泻发生后盲肠有益微生物数量降低,有害微生物数量升高;菌群结构有差异但不显著(P>0.05),腹泻獭兔盲肠菌群结构有复杂化的趋势。
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