中国HIV-1主要流行重组株B/CTat基因第一外显子序列特征分析

被引：2

作者：

黄海龙 ^{[1
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邢辉 ^{[2
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马鹏飞 ^{[2
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关琪 ^{[2
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魏民 ^{[2
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洪坤学 ^{[2
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陈建平 ^{[2
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梁浩 ^{[2
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司雪峰 ^{[2
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全宇 ^{[2
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谢必峰 ^{[1
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邵一鸣 ^{[2
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机构：

[1] 福建师范大学生物工程学院

[2] 中国疾病预防控制中心性病艾滋病预防与控制中心病毒免疫室

来源：

中华实验和临床病毒学杂志 | 2006年 / 04期

关键词：

HIV-1; 序列分析; 流行重组模式;

D O I：

暂无

中图分类号：

R373 [人体病毒学（致病病毒）];

学科分类号：

摘要：

目的研究我国人类免疫缺陷病毒1型(HIV-1)流行重组株B/CTat基因第一外显子变异特点,探讨这些变化对其功能的影响。方法从确诊的HIV-1感染者全血样本中提取基因组DNA,经套式聚合酶链反应(PCR)扩增和测序。使用GCG和Bioedit软件中的程序进行系统进化树和氨基酸变异分析,同时进行网上三级结构预测。结果总计154份样品中CRF07-BC为120份,CRF08-BC为34份,两种亚型有较广泛的分布,CRF07-BC与标准株的平均基因离散率为(5.748±1.352),CRF08-BC与标准株的平均基因离散率为(1.259±1.931)。结论我国流行重组株CRF07-BC比CRF08-BC有较长的流行时间,CRF07-BC与CRF08-BC基因第一外显子氨基酸相比,主要为半胱氨酸富含区和核心区的变化。在这两个区位点变化可能影响Tat与细胞因子如cyclinT1的结合能力,而成为CRF07-BC在我国流行中获得传播优势的原因。

引用

页码：390 / 392

页数：3

共 3 条

[1] 我国HIV-1 B'/C重组流行株Tat蛋白的表达、纯化及功能分析 [J].