基于16S rDNA不同靶序列对厌氧ABR反应器微生物多样性分析的影响

被引：9

作者：

魏利 ^{[1
]}

马放 ^{[1
]}

王欣宇 ^{[2
]}

刘雅丽 ^{[2
]}

王丽娜 ^{[2
]}

李维国 ^{[1
]}

机构：

[1] 哈尔滨工业大学市政环境与工程学院水质保障与水资源可持续利用国家重点实验室黑龙江省环境生物技术重点实验室

[2] 东北林业大学林学院

来源：

环境科学 | 2008年 / 03期

关键词：

DGGE; 16SrDNA; 厌氧污泥; 群落多样性;

D O I：

10.13227/j.hjkx.2008.03.015

中图分类号：

X172 [环境微生物学];

学科分类号：

071012 ; 0713 ;

摘要：

在反硝化抑制硫酸盐还原菌的研究中,探讨了不同引物扩增16S rDNA靶序列对厌氧ABR反应器的活性污泥DGGE图谱多样性的影响,从反应器中提取污泥总DNA,以4对通用引物341F/534R、968F/1401R、63F/534R、341F/926R扩增16S rDNA序列,对指纹图谱的分辨率和种群多样性进行分析.研究表明,采用PBS洗涤污泥和超声振荡有利于硫酸盐还原污泥总DNA提取;不同引物DGGE图谱分析,群落多样性存在显著的差异,341F/534R和968F/1401R的靶序列分离效果较好,341F/926R分离效果一般,63F/534R分离的效果最差.341F/534R的DGGE图谱中条带丰富,多样性最好,968F/1401R的DGGE图谱次之,341F/926R的DGGE图谱条带一般,63F/534R图谱条带最少,多样性也较差.建议DGGE分析厌氧活性污泥样品时,同时采用引物341F/534R和968F/1401R是比较适宜的.

引用

页码：776 / 780

页数：5

共 5 条

[1] 大港孔店油田水驱油藏微生物群落的分子分析 [J].