探针荧光定量PCR在肺炎链球菌检测中的应用

被引:3
作者
曹东林
胡亮杉
林茂锐
王婷
黄基伟
田军章
机构
[1] 广东省第二人民医院检验科
关键词
肺炎链球菌; 聚合酶链反应; 荧光探针;
D O I
暂无
中图分类号
R440 [];
学科分类号
摘要
目的建立探针荧光定量PCR检测肺炎链球菌的方法。方法针对肺炎链球菌种属特异性基因lytA,设计合成了特异引物和探针,研究引物和探针的灵敏度和特异性,确定循环阈值(cycle threshold,ct)的临界值(cut-off value)。将荧光定量PCR和细菌培养法进行比较,同时检测158份肺炎患者痰液标本加以验证。结果针对LytA基因所设计的引物和探针能灵敏地检出常见致病的血清型肺炎链球菌株,检测灵敏度为每个反应100个基因组DNA拷贝。通过荧光量PCR方法,35株肺炎链球菌中检测结果为阳性有34株,检测结果为阴性的有1株;15株非肺炎链球菌全部为阴性。通过荧光定量PCR方法,158份痰液标本中共检测出34份肺炎链球菌阳性,其中10份培养出相应的病原菌。肺炎链球菌阳性患者的白细胞数量和住院时间均显著高于阴性患者(P<0.05)。肺炎链球菌阳性患者住院时间均显著长于阴性患者(P<0.05)。结论探针荧光定量PCR方法能特异地检测肺炎链球菌,具有很高的灵敏度,能提高临床肺炎链球菌感染患者标本的阳性检出率。
引用
收藏
页码:102 / 104
页数:3
相关论文
共 9 条
  • [1] A duplex SYBR Green I real-time quantitative PCR assay for detecting Escherichia coli O157:H7. Yang X,Cheng HW,Chen L,et al. Genetics and Molecular Research . 2013
  • [2] Molecular characterizations of PCRpositive Mycoplasma pneumoniae specimens collected from Australia and China. Xue G,Wang Q,Yan C,et al. Journal of Clinical Microbiology . 2014
  • [3] 社区获得性肺炎病原谱构成及初始经验性抗菌药物应用的争议
    何礼贤
    陈雪华
    [J]. 中国实用内科杂志, 2007, (02) : 110 - 113
  • [4] 社区获得性肺炎病原体流行病学、耐药性及诊断研究进展
    苏欣
    施毅
    宋勇
    [J]. 中国呼吸与危重监护杂志, 2005, (04) : 321 - 326
  • [5] Epidemiology of clinically diagnosed community-acquired pneumonia in the primary care setting: results from the 1999–2000 respiratory surveillance program[J] . Mark H Gotfried. &nbspThe American Journal of Medicine . 2001 (9)
  • [6] Rapid diagnosis of bacterial meningitis by real-time PCR and fluorescence in situ hybridization. Poppert Sven,Essig Andreas,Stoehr Barbara,Steingruber Adelinde,Wirths Beate,Juretschko Stefan,Reischl Udo,Wellinghausen Nele. Journal of Clinical Microbiology . 2005
  • [7] Sensitive and specific method for rapid identification of Streptococcus pneumoniae using real-time fluorescence PCR. McAvin J C,Reilly P A,Roudabush R M,Barnes W J,Salmen A,Jackson G W,Beninga K K,Astorga A,McCleskey F K,Huff W B,Niemeyer D,Lohman K L. Journal of Clinical Microbiology . 2001
  • [8] Macrolide resistance of Mycoplasma pneumoniae and its detection rate by real-time PCR in primary and tertiary care hospitals. Uh Y,Hong JH,Oh KJ,et al. Ann Lab Med . 2013
  • [9] Microbial Etiology of Community-Acquired Pneumonia in the Adult Population of 4 Municipalities in Eastern Finland. Jokinen Camilla,Heiskanen Leena,Juvonen Helvi,Kallinen Sakari,Kleemola Marjaana,Koskela Markku,Leinonen Maija,R?nnberg Pirjo-Riitta,Saikku Pekka,Stén Marja,Tarkiainen Airi,Tukiainen Hannu,Py?r?l? Kalevi,M?kel? P. Helena. Clinical Infectious Diseases . 2001