应用锚定ISSR技术对21个栽培黑木耳(Auricularia auricula)菌株进行了遗传多样性研究。从20个引物中选出10个ISSR引物,扩增得到185个扩增位点,大小分布在200~3000bp之间,其中多态性位点181个,多态性位点占97.84%,表明ISSR标记的多态性非常高。平均每个位点的观察等位基因数(Na)为1.9784,每个位点的有效等位基因数(Ne)为1.2396;菌株间平均Nei基因多样性(h)为0.2732,Shannon信息指数(I)为0.4278。Nei(1972)遗传距离矩阵分析表明21个黑木耳菌株间遗传距离在0.36到0.55之间,基因流(Nm)达到2.7528,表明我国栽培黑木耳的遗传背景十分丰富,遗传多样性很高,同时表明我国各地域间栽培黑木耳菌株存在着很大的菌种交流。