一株野生细菌的16Sr DNA序列分析与系统发育树的构建

被引:24
作者
张会敏
冯友军
机构
[1] 广西大学
关键词
细菌; 16SrDNA; 系统发育树;
D O I
暂无
中图分类号
Q939 [微生物分类学(系统微生物学)];
学科分类号
摘要
以野生细菌F0 30 3的总DNA为模板 ,采用细菌 16SrDNA的通用引物 ,通过PCR的方法扩增到一条约 1.5Kb的 16SrDNA片段。连接到pGEM -T -easy克隆载体上 ,并用化学法转化E .coliDH5α。用EcoRI对 5个随机挑取的转化子进行的酶切分析表明这 5个转化子皆为阳性。DNA测序表明该PCR扩增到的 16SrDNA片段长为 14 75核苷酸。与GenBank上已提交的16SrDNA进行的比对 (BLAST)表明野生细菌F0 30 3归属于沙雷氏属。由VectorNTISuite 6软件构建的系统发育树表明与深红色沙雷氏细菌 (Serratiarubidaea)亲源关系最近 ,在核苷酸水平有 97.8%的相似性。
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