铜鱼线粒体控制区的序列变异和遗传多样性

被引:23
作者
袁娟 [1 ]
张其中 [1 ,2 ]
李飞 [1 ,3 ]
朱成科 [1 ]
罗芬 [4 ]
机构
[1] 西南大学生命科学学院,水产科学重庆市市级重点实验室,三峡库区生态环境教育部重点实验室
[2] 暨南大学水生生物研究所
[3] 第三军医大学中心实验室
[4] 宁德高等师范专科学院生物系
关键词
铜鱼; 线粒体控制区; 遗传多样性;
D O I
暂无
中图分类号
S917.4 [水产动物学];
学科分类号
摘要
采用PCR和DNA测序技术研究长江中上游野生铜鱼的遗传多样性和群体遗传学特征,从9个采样点共获得100尾铜鱼,用于分析的线粒体DNA控制区的片段序列为946bp。在100个序列中,共检测出变异位点47个(其中增添/缺失位点8个),单倍型41种。9个地理群体的平均单倍型多样性(Hd)和平均核苷酸多样性(Pi)分别为0.9257±0.0162和0.004178±0.002337,表现出较贫乏的遗传多样性。群体间的分化指数(FST值)、平均基因流(Nm)、分子方差分析(AMOVA)和平均K2-P遗传距离均表明9个铜鱼地理群体间存在广泛的基因交流,未明显发生群体遗传分化。另外,共享单倍型比例较高,约为34%(14/41)。单倍型的UPGMA分子系统树和简约网络图显示单倍型的聚类与地理分群没有相关性。上述结果表明9个铜鱼地理群体属于同一种群。
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