应用关联规则筛选疾病相关的SNP位点及其组合的分析方法

被引：11

作者：

邹莉玲 ^{[1
,2
]}

赵耐青 ^{[1
]}

秦国友 ^{[1
]}

钱吉 ^{[3
]}

邵敏华 ^{[3
]}

机构：

[1] 复旦大学公共卫生学院卫生统计和社会医学教研室

[2] 同济大学医学院预防医学教研室

[3] 复旦大学生命科学学院遗传学研究所

来源：

中国卫生统计 | 2009年 / 26卷 / 03期

关键词：

关联规则; 基因变异; SNP位点; 肺癌;

D O I：

暂无

中图分类号：

R246 [针灸疗法临床应用];

学科分类号：

100512 ;

摘要：

目的探讨应用关联规则(association rules)挖掘技术筛选对疾病表型相关的基因SNP位点的分析方法。方法应用关联规则挖掘技术,从中国肺癌病例对照研究的核苷酸切除修复通路(nucleotide exicision repair,NER)基因SNP位点筛选与肺癌有关联的SNP位点及其组合,作为logistic回归模型的待选解释变量作进一步确认性研究。结果发现与肺癌易感性可能相关的基因变异位点,并且发现位点ERCC1-rs3212951和ERCC1-rs3212955之间可能存在交互作用。结论关联规则挖掘技术可以作为疾病相关的SNP位点及交互作用的初筛手段,有效地找到肺癌等复杂性状疾病相关的基因多态位点和交互作用项。

引用

页码：226 / 228+233 +233

页数：4

共 3 条

[1] 应用关联规则挖掘构建人小脑发育的基因表达关联网络 [J].