棉花LIM结构域基因(GhLIM1)的克隆和表达分析

LIM结构域蛋白是一个重要的发育调控因子 ,参与基因转录、细胞骨架建成和信号传导等许多发育调控过程。胞质骨架是形成和稳定细胞形态以及传递物质、能量和信息的重要成分。为研究棉花纤维细胞发育过程中胞质骨架的形成和作用机理 ,通过棉花纤维EST序列整合 ,从陆地棉徐州 14 2胚珠 (含纤维 )中扩增并克隆出棉花LIM结构域基因的编码区段。该棉花LIM结构域基因 (GhLIM1)长 84 8bp ,包含一个 5 70bp的开放阅读框 ,推导的氨基酸序列 (189个氨基酸 )与拟南芥、烟草和向日葵的LIM结构域蛋白有极高的同源性 ,而且两个LIM结构域完整。每个LIM结构域具有植物LIM结构域共有的双锌指结构C X2 C X17～ 19 H X2 C X2 C X2 C X16～ 2 4 C X2 H。RT PCR和Northern杂交分析表明 ,该基因 (GhLIM1)在陆地棉的根、茎尖、下胚轴、叶片、花蕾、花药、胚珠和不同发育时期的陆地棉纤维 (4DPA、12DPA、18DPA)以及海岛棉纤维 (18DPA)和中棉纤维 (12DPA)中均有表达 ,但GhLIM1基因在茎尖、纤维和有纤维的胚珠中表达量更高 ,因此GhLIM1基因应与棉花纤维发育有密切关系。