穗花杉ISSR引物反应条件的优化与筛选

被引:35
作者
朱柏芳 [1 ]
朱笃 [1 ]
邓荣根 [1 ]
李思光 [2 ]
机构
[1] 江西师范大学生命科学学院/江西省亚热带植物资源保护与利用重点实验室
[2] 南昌大学生物工程系
关键词
ISSR; 引物筛选; 穗花杉;
D O I
暂无
中图分类号
S791.52 [穗花杉];
学科分类号
090702 [森林培育];
摘要
在研究穗花杉(Am entotaxus aragotaenia)的遗传多样性过程中,为了获得清晰、重复性好ISSR扩增结果,对影响ISSR-PCR的多个因素包括模板浓度、Taq酶的选择和用量、Mg2+和dNTPs浓度及退火温度等指标等进行了筛选和优化,确定了穗花杉ISSR-PCR分析的最适扩增条件:20μL PCR反应体系中,2μL 10×Taq酶配套缓冲液,1.8 U Taq聚合酶(上海生工公司),0.2μmol.L-1引物,0.18 mmol.L-1dNTP,1.5~2.5 mmol.L-1MgC l2,10 ng.μL-1模板DNA。用来自不同居群7个个体,以100个ISSR引物进行PCR扩增,筛选出扩增效果较好的10个引物。得到了92个位点,其中45个多态性位点,多态性位点比例为49%。
引用
收藏
页码:318 / 322
页数:5
相关论文
共 6 条
[1]
红树植物海漆ISSR条件的优化 [J].
张志红 ;
谈凤笑 ;
何航航 ;
吴令辉 ;
钟才荣 ;
施苏华 .
中山大学学报(自然科学版), 2004, (02) :63-66
[2]
五针松胚乳ISSR—PCR反应体系的建立 [J].
吕艳芳 ;
刘桂丰 ;
姜静 ;
侯英杰 .
植物研究, 2003, (04) :429-432
[3]
简单重复序列区间(ISSR)引物反应条件优化与筛选 [J].
余艳 ;
陈海山 ;
葛学军 .
热带亚热带植物学报, 2003, (01) :15-19
[4]
中国珍稀濒危保护植物名录.[M].国家环境保护局;中国科学院植物研究所编;.科学出版社.1987,
[5]
Inter simple sequence repeat analysis of genetic relationships in the genus <Emphasis Type="BoldItalic">Vigna</Emphasis>.[J].S.R. Ajibade;N.F. Weeden;S.M. Chite.Euphytica.2000, 1
[6]
Genetic diversity and relationships of sweetpotato and its wild relatives in Ipomoea series Batatas (Convolvulaceae) as revealed by inter-simple sequence repeat (ISSR) and restriction analysis of chloroplast DNA [J].
Huang, JC ;
Sun, M .
THEORETICAL AND APPLIED GENETICS, 2000, 100 (07) :1050-1060