本试验通过采集乌鲁木齐燕儿窝种牛场2003年5月份所有泌乳奶牛的牛奶样品,使用不同超声波功率(0、100、120、140、160W)处理后,采用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)、十二烷基磺酸钠(SDS)法提取牛奶中细菌DNA,并通过DNA浓度、纯度和细菌通用引物扩增16SrDNA的V6-V8区判定DNA的质量,筛选出提取牛奶中细菌DNA的最佳方法。结果表明,未使用超声波处理样品,直接采用CTAB、SDS法提取出的DNA无法扩增出细菌16SrDNA V6-V8区,而使用不同超声波功率(100、120、140、160W)处理后能扩增出细菌16SrDNA V6-V8区,其中超声波功率140W处理样品10min并结合CTAB法提取牛奶中细菌DNA的浓度最高,为203.35μg/mL。因此,超声波功率140W处理样品并结合CTAB法提取牛奶中细菌DNA的方法最优,能满足从分子水平上进一步研究乳房炎相关细菌的要求。