茶树EST-SSR的信息分析与标记建立

被引：87

作者：

金基强 ^{[1
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崔海瑞 ^{[1
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陈文岳 ^{[2
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卢美贞 ^{[1
]}

姚艳玲 ^{[1
]}

忻雅 ^{[2
]}

龚晓春 ^{[1
]}

机构：

[1] 浙江大学原子核农业科学研究所

[2] 杭州市农业科学院

来源：

茶叶科学 | 2006年 / 01期

关键词：

茶树; EST; SSR信息; 标记建立;

D O I：

10.13305/j.cnki.jts.2006.01.003

中图分类号：

S571.1 [茶];

学科分类号：

0902 ; 090203 ;

摘要：

在1589条茶树EST中,共发掘出了281个EST-SSR,分布于246条EST中,出现频率是17.68%,平均长度为33.06bp,平均分布频率是1/2.61kb。在茶树EST-SSR中,二核苷酸重复是主要的重复类型,出现最多的重复基元类型是AG/CT重复。设计了19对SSR引物,在对引物、dNTP、MgCl2的浓度及退火温度等参数进行测试后,建立了合适的PCR反应体系。以衍生绝大多数EST-SSR的龙井43DNA为模板,对引物进行了筛选,有16对引物显示扩增,可用率为84.2%;进一步在10个茶树品种中进行多态性测试,显现出多态性的引物占可扩增引物的62.5%。本文研究结果证明了根据茶树EST建立SSR标记是有效、可行的。

引用

页码：17 / 23

页数：7

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