核桃SSR反应体系的优化

被引:39
作者
刘晓丽 [1 ]
何天明 [2 ]
张美勇 [3 ]
张立杰 [1 ]
慈志娟 [1 ]
张春雨 [1 ]
陈学森 [1 ]
机构
[1] 山东农业大学果树生物学实验室
[2] 塔里木大学植物科技学院
[3] 山东省果树研究所
关键词
核桃; SSR; 优化;
D O I
10.13925/j.cnki.gsxb.2007.02.003
中图分类号
S664.1 [核桃(胡桃)];
学科分类号
090201 [果树学];
摘要
以清香、香铃、爱米格为试材,利用CTAB法提取基因组DNA,将PCR体系的主要成分设定5个梯度,根据每个成分的变化引起的PCR-SSR的效果差异,探讨了核桃SSR技术中PCR体系的主要成分对扩增结果的影响,并对引物WGA321的适宜退火温度进行优化。最终确定了引物WGA321的最适退火温度为48~52℃,PCR反应体系的最佳条件为:15μL体系中,Mg2+1.0mmol/L,dNTPs浓度0.40mmol/L,TaqE用量为0.5U,DNA模板1.0ng/μL,引物浓度为0.4μmol/L。利用此反应体系对部分核桃品种进行PCR扩增并电泳检测,扩增结果清晰且有较高的多态性,表明该体系适合核桃的亲缘关系分析。
引用
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