中华哲水蚤线粒体DNA COI基因序列分析

被引：19

作者：

林元烧

方旅平

曹文清

李少菁

机构：

[1] 厦门大学海洋学系,厦门大学海洋学系,厦门大学海洋学系,厦门大学海洋学系福建厦门,福建厦门,福建厦门,福建厦门

来源：

厦门大学学报(自然科学版) | 2005年 / 01期

关键词：

中华哲水蚤; 线粒体DNA; COI基因; 青岛;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q953 [动物遗传学];

学科分类号：

071007 ; 090501 ;

摘要：

采用苯酚氯仿异戊醇(25∶24∶1)提取、异丙醇沉淀、酒精洗涤、TE缓冲液保存方法提取了采自胶州湾青岛海域的中华哲水蚤基因组DNA;以相应引物经PCR扩增得到线粒体DNA细胞色素氧化酶 I亚基基因(mtCOI)片段;PCR产物采用化学法进行质粒重组(载体pGEM T Easy Vector)、热休克转化重组质粒至大肠杆菌感受态细胞(JM109)、氨苄LB培养基扩大培养;测序.结果表明,中华哲水蚤线粒体COI碱基大小为710 bp(国际基因库索引号AY665663),其碱基组成A、C、G、T含量分别为24.23%、19.15%、22.54%和34.08%;G+C含量为41.69%,A+T为58.31%.

引用

页码：90 / 93

页数：4

共 5 条

[1] 黄、东海中华哲水蚤种群遗传的初步研究——I:等位酶分析 [J].

谭树华 ;

林元烧 ;

曹文清 ;

陈钢 ;

杨明 .

厦门大学学报(自然科学版), 2003, (01) :87-91

[2] 中华哲水蚤不同地理种群苹果酸脱氢酶(MDH)的比较 [J].

曹文清 ;

杨明 ;

谭树华 ;

林元烧 ;

郭东晖 .

海洋科学, 2002, (08) :18-20

[3] 厦门港中华哲水蚤染色体组型 [J].

林元烧 ;

曹文清 ;

姚津津 .

厦门大学学报(自然科学版), 2000, (06) :826-830

[4]

Taxonomic and systematic assessment of planktonic copepods using mitochondrial COI sequence variation and competitive, species-specific PCR[J] . A. Bucklin,M. Guarnieri,R.S. Hill,A.M. Bentley,S. Kaartvedt.Hydrobiologia . 1999 (0)

[5]

The mitochondrial DNA molecule ofDrosophila yakuba: Nucleotide sequence, gene organization, and genetic code[J] . Douglas O. Clary,David R. Wolstenholme.Journal of Molecular Evolution . 1985 (3)

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