代表活性污泥中苯酚降解菌群的ERIC-PCR产物片段的多态性

被引：9

作者：

高平平

王健

席玉英

赵立平

机构：

[1] 山西大学生物技术研究所,山西大学生物技术研究所,山西大学环境与资源学院,上海交通大学生命科学技术学院太原,太原,太原,上海

来源：

生态学报 | 2003年 / 06期

关键词：

群落结构ERIC-PCR指纹图; 特征性条带; 基因组片段测序;

D O I：

暂无

中图分类号：

X172 [环境微生物学];

学科分类号：

071012 ; 0713 ;

摘要：

对可能代表活性污泥中两个时期的主要苯酚降解菌群的 ERIC- PCR指纹图谱中的两条 2 .1 kb的条带 ( P1和 P8)中的 DNA片段进行克隆、转化 ,得到 1 93个转化子。 H inf I物理图谱分析得到 35种酶切类型 ,将两端各进行 1次测序后 ,同源性大于 90 %的克隆归为一类 ,共得到 1 0种序列类型。对各类型的代表克隆进行了全长测序 ,5种类型为 P1条带所有 ,3种类型为 P8所有 ,二者共享的类型为 2种 ,丰度最高的片段为 S3,P1条带中 76.3%的转化子和 P8条带中 66.7%转化子属该类型。对所得序列进行检索分析 ,它们与 Gen Bank中已知基因序列均无显著同源性。用 S3特异性引物对活性污泥样品及其它在 LB、d CGY、MP和 FWM培养基上的回收菌进行扩增 ,除 LB上的回收菌没有显示目的条带外 ,活性污泥和其回收菌中均检测到带有该基因组片段的菌种的存在。研究为专一性分离降酚活性污泥中的优势菌提供了分子探针

引用

页码：1095 / 1100

页数：6

共 9 条

[1] 可用于微生物群落分子生态学研究的活性污泥总DNA提取方法研究 [J].