一个大数据库中预测蛋白质二级结构

被引：3

作者：

冯永娥 ^{[1
]}

罗辽复 ^{[2
]}

机构：

[1] 内蒙古农业大学理学院

[2] 内蒙古大学物理科学与技术学院

来源：

内蒙古农业大学学报(自然科学版) | 2012年 / 33卷 / 01期

关键词：

蛋白质二级结构; 4肽结构字; 多样性增量; 二次判别法; 允许误差范围;

D O I：

10.16853/j.cnki.1009-3575.2012.01.049

中图分类号：

Q51 [蛋白质];

学科分类号：

070307 [化学生物学];

摘要：

本文在1个大数据库中采用广义的2次判别法来预测蛋白质二级结构。在包含2640个蛋白的数据库中,先是定义4肽结构字,然后利用3种4肽结构字建立多样性源同时结合二次判别法来预测21残基片段中心残基的二级结构,最后在误差允许范围内对预测结果进行修正,自洽检验和独立检验的三态预测精度均超过83%。在同样的数据库中,与其它预测软件相比较,显示了我们的方法是占优势的。

引用

页码：225 / 230

页数：6

共 4 条

[1]

Use of tetrapeptide signals for protein secondary-structure prediction [J].