基因表达谱芯片发现36条喉鳞癌相关基因

目的 :研究探讨喉鳞癌发生、发展中相关基因群的表达和初步功能。 方法 :按微矩阵排列的 40 96种全长基因 PCR产物制成 Bio Door40 96型微矩阵表达谱芯片 ;采用条件优化的一步法抽提喉鳞癌及正常组织总 RNA,用 Qiagen公司 Oligotexm RNA离心柱分离纯化两种组织的 m RNA;经逆转录合成荧光分子 (Cy3/ Cy5 )掺入的 c DNA一链制备表达谱探针 ,芯片杂交和严格洗片后 ,用 Scan Array30 0 0荧光扫描仪扫描芯片荧光信号图像 ,利用计算机分析肿瘤及正常组织中差异表达的基因。对所获得的基因进行分子生物信息学分析。结果 :在 40 96种基因中 ,喉鳞状细胞癌与正常组织间存在差异表达的基因。在所检测的 4对临床标本中 ,发现有差异表达的基因 36条 (0 .88% )。生物信息学分析显示 ,该 36条差异表达基因与肿瘤的发病机制可能存在相关性。结论 :喉鳞状细胞癌的发生、发展中存在多基因表达调控的改变 ,对于相关基因群的研究有助于认识肿瘤发病机制