利用抑制消减杂交技术研究钩端螺旋体致病相关基因

被引:13
作者
鲍朗
胡昌华
李学敏
晏菊芳
张万江
张会东
机构
[1] 华西医科大学感染免疫研究室
关键词
钩端螺旋体; 基因组差异; 抑制消减杂交;
D O I
暂无
中图分类号
R377.5 [];
学科分类号
100103 ; 100705 ;
摘要
目的 利用抑制消减杂交技术 (SSH) ,比较致病与非致病钩端螺旋体 (简称钩体 )之间基因组差异 ,筛选致病钩体特有的基因片段。方法 以赖型 0 1 7株为tester,非致病性patocⅠ株为driv er,选择合适的四碱基内切酶将基因组酶切 ,连接特殊设计的adaptor进行消减杂交和PCR ,得到消减混合物 ,与T/A克隆载体连接 ,转化JM1 0 9建立差异消减文库 ,经PCR和Southernblot筛选鉴定阳性克隆 ,进而对部分片段进行测序和同源分析。结果 AluⅠ适于将钩体酶切成用于SSH技术的小片段 ;经SSH筛选鉴定得到 3 0个片段大小为 2 0 0~ 1 3 0 0bp的阳性克隆 ,部分已测序的片段中 1个与硫胺素合成蛋白高度同源 ,4个与GenBank无明显同源性 ,可能为赖型致病钩体所特有而非致病钩体缺失的基因片段 ,已被GenBank收录 ,收录号分别为AF3 0 0 873~ 3 0 0 877。结论 SSH是一种有效、灵敏、高特异的比较分析基因组差异的方法 ,对钩端螺旋体致病基因的筛选、基因组分化、分子遗传研究等具有重要意义。
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共 2 条
[1]   中国钩端螺旋体强毒株017膜蛋白基因的质粒载体构建及表达 [J].
晏菊芳 ;
鲍朗 ;
伍卫华 ;
万波 ;
李胜富 .
中华微生物学和免疫学杂志, 1999, (02) :33-36
[2]  
Identification and localization of differences between Escherichia coli and Salmonella typhimurium genomes by suppressive subtractive hybridization[J] . M. L. Bogush,T. V. Velikodvorskaya,Yu. B. Lebedev,L. G. Nikolaev,S. A. Lukyanov,A. F. Fradkov,B. K. Pliyev,M. N. Boichenko,G. N. Usatova,A. A. Vorobiev,G. L. Andersen,E. D. Sverdlov.MGG - Molecular and General Genetics . 1999 (4-5)