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木耳属菌株ITS序列作为DNA条形码的可行性
被引:9
作者
:
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王晓娥
姚方杰
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张友民
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张友民
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方明
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吉林农业大学
陈影
机构
:
[1]
吉林农业大学
来源
:
东北林业大学学报
|
2013年
/ 41卷
/ 07期
关键词
:
木耳属;
DNA条形码;
种内与种间序列差异;
D O I
:
10.13759/j.cnki.dlxb.2013.07.025
中图分类号
:
S646.6 [木耳(云耳、黑木耳)];
学科分类号
:
摘要
:
以木耳属22个菌株为供试材料,研究了rDNA-ITS序列作为木耳属条形码的可行性。结果表明:ITS序列作为木耳属条形码的有效长度为420 bp左右,片段长度大小适宜,扩增与测序成功率均为100%。种内ITS序列差异度为0.5%~2.5%,种间序列差异度为4.8%~10.8%,种间序列差异显著高于种内序列差异。在此基础上,以黑耳属为外群构建系统树,结果表明ITS序列可以区分木耳属不同的种。综上所述,ITS序列作为木耳属的DNA条形码是可行的。
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