中医五运六气理论是融合古代天文历法、气象物候、藏象病候等知识形成的中医经典理论,用干支甲子的四时主客变化阐释自然、生命与疾病的时空规律,其理论本源已呈现多学科交汇融合的学术特征。21世纪以来学术活跃度及影响力逐渐增强,缘于主题涉猎广泛、研究数据多样、相关性分析复杂等,现代五运六气研究明显呈现信息时代的大数据4V特征,适时思考其间涉及的医学伦理学问题已迫在眉睫。中国知网检索显示,学界尚未对五运六气研究本身涉及的医学伦理问题给予足够重视。在享受智能在线获取、大数据共享的时代,五运六气研究的知情同意、隐私保护、数据安全监管、算法评价等问题尤为突出,需要在注重多学科融合协作、多样态数据共享等技术进步的同时,尽快提升全部研究参与者以及研究全过程的医学伦理学观念,以褒扬大数据时代凸显的自主、尊严、安全、公平等医学伦理精神。