家蚕核型多角体病毒中国株和日本株vp39基因的比较研究

以苜蓿丫纹夜蛾核型多角体病毒 (AcNPV)的核衣壳蛋白基因vp39设计引物 ,用PCR技术扩增了家蚕核型多角体病毒中国株 (BmNPV Ch)～ 1.3kb片段 ,并测定了其全序列长 12 30bp。推导的氨基酸 351个 ,其与BmNPV日本株 (BmNPV Ja)vp39基因核苷酸序列同源性达 97.5% ,氨基酸同源性达 97.1%。该片段在E .coliBL2 1中诱导表达能产生分子量约为 38kD的特征性蛋白带 ,证明所扩增片段为BmNPV Ch的vp39基因。经与BmNPV Ja比较 ,其 6 2 5位有 3个核苷酸(CGA) ,985～ 910位有 6个核苷酸 (GTCGGC)的插入 ,未造成码组移动。有 17处点突变 ,但取代突变 (replacementmutation)仅 7处 ,对两株病毒VP39蛋白的亲疏水性和酸碱性质未产生显著影响。由于点突变带来氨基酸改变 ,使BmNPV Ch的vp39蛋白的α 螺旋由 13.2 %增加到 15.4 % ,无规卷曲由 7.2 %减少到 5.8% ,β 折叠和β 转角维持不变 ,约为 79.6 % ,仍保持以β 折叠为主要二级结构单元的片层状折叠结构。