绵羊PRNP等位基因PCR-SSCP分析条件的优化

被引:8
作者
赵春林 [1 ]
王川 [1 ]
吴润 [1 ]
李发弟 [1 ]
柳纪省 [2 ]
机构
[1] 甘肃农业大学动物医学院
[2] 中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室
基金
高等学校博士学科点专项科研基金;
关键词
绵羊; PRNP等位基因; 聚合酶链式反应-单链构象多态性; 正交试验; 分析条件优化;
D O I
10.16656/j.issn.1673-4696.2008.08.016
中图分类号
S826 [羊];
学科分类号
090502 [动物营养与饲料科学];
摘要
为进行绵羊PRNP等位基因密码子136、154、171的多态性研究,建立适合于绵羊PRNP等位基因开放阅读框(ORF)内高变区PCR-SSCP分析方法,对凝胶浓度、交联度、甘油浓度、电泳电压、电泳时间、PCR产物与变性缓冲液比例、电泳缓冲液浓度、上样量等影响因素进行了优化试验。在优化中引入了正交试验法,以使优化过程简化,结果可靠。结果表明,交联度49∶1、甘油浓度0%、凝胶浓度12%、电泳电压200 V、PCR产物上样量≥2.0μL且<4.0μL、PCR产物与变性缓冲液比例1∶4、0.5×TBE缓冲液及4℃电泳45 h为最佳试验条件,据此建立了绵羊PRNP等位基因136、154、171密码子的PCR-SSCP分析方法。
引用
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