土壤细菌群落密度实时荧光定量PCR检测体系的建立

被引：21

作者：

顾卿 ^{[1
,2
]}

许艳丽 ^{[1
]}

魏巍 ^{[1
,3
]}

刘爽 ^{[4
]}

机构：

[1] 中国科学院东北地理与农业生态研究所黑土区农业生态院重点实验室,海伦农田生态系统国家野外观测研究站

[2] 东北林业大学

[3] 中国科学院研究生院

[4] 中国科学院生态环境研究中心

来源：

土壤与作物 | 2012年 / 1卷 / 02期

关键词：

土壤微生物; 实时荧光定量PCR; 绝对定量;

D O I：

暂无

中图分类号：

S154.3 [土壤微生物学];

学科分类号：

090301 [土壤学];

摘要：

为了建立土壤环境样品中细菌群落的定量分析体系,选用了多环芳烃污染土壤处理P1和P2,以及无多环芳烃污染的裸地生态系统土壤C等3种处理,利用构建克隆子的方法制作标准样品,并对实时荧光定量PCR标准曲线的线性(R2)、扩增效率(E)以及斜率(S)等相关参数进行了优化。结果表明,标准曲线的线性R2=0.985、扩增效率E=101.7%以及斜率S=-3.282,均符合参数符合要求。土壤样品P1、P2和C的细菌16SrDNA片段拷贝数为1.4×109个·g-1、4.0×109个·g-1和5.0×109个·g-1。说明建立的实时荧光定量PCR检测体系可以灵敏地定量未知模板的土壤细菌数量。图3,参11。

引用

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页数：4

共 10 条

[1]

限制性片段长度多态性分析(ARDRA)方法对重金属污染土壤中细菌群落多样性的研究 [J].