大肠杆菌ERIC-PCR分子分型方法的建立及其初步应用

被引：13

作者：

张辉 ^{[1
]}

杨振泉 ^{[2
]}

赵隽 ^{[3
]}

魏瑞成 ^{[1
]}

王冉 ^{[1
]}

机构：

[1] 江苏省农业科学院农业部食品安全监控重点开放实验室,江苏省食品质量安全重点实验室——省部共建国家重点实验室培育基地,江苏省畜禽产品安全性研究重点实验室

[2] 扬州大学食品科学与工程学院

[3] 扬州大学生物科学与技术学院

来源：

江苏农业学报 | 2010年 / 05期

关键词：

大肠杆菌; ERIC-PCR; 分子分型;

D O I：

暂无

中图分类号：

Q78 [基因工程（遗传工程）];

学科分类号：

071007 ; 0836 ; 090102 ;

摘要：

为建立高效、敏感的肠杆菌科基因间重复一致序列PCR(ERIC-PCR)的分子分型方法,该研究提取大肠杆菌基因组DNA,以此为模板建立和优化ERIC-PCR分型体系,并采用ERIC-PCR方法对62株大肠杆菌进行分子分型和遗传相似性统计分析。结果显示从提取的大肠杆菌基因组中能够扩增到2～8条DNA片段,且大部分片段在100 bp至2 000 bp之间。通过4因素3水平正交试验,建立了较为稳定的ERIC-PCR分型方法。利用ERIC-PCR方法可将62株菌分为20型,其中以A型为优势菌群。遗传相似性结果表明,各菌株之间遗传相似性有较大的变化,但部分菌株高度同源。聚类分析表明,ERIC-PCR的分辨率系数为0.937,具有较高的分辨能力。表明应用ERIC-PCR分型技术在分子水平上对大肠杆菌进行鉴别和分型,具有简便和分辨力高等优点,能够对病原进行溯源分析,在大肠杆菌的分子流行病学研究中具有广泛的应用前景。

引用

页码：1098 / 1103

页数：6

共 4 条

[1]

A simple and rapid method for extracting bacterial DNA from intestinal microflora for ERIC-PCR detection[J]. Jin-Long Yang, Chuan-Feng Li, Shu-Xuan Deng, Avian Diseases Research Center, College of Veterinary Medicine of Sichuan Agricultural University, Yaan 625014, Sichuan Province, China An-Chun Cheng, Ming-Shu Wang, Kang-Cheng Pan, Avian Diseases Research Center, College of Veterinary Medicine of Sichuan Agricultural University;Key Laboratory of Animal Diseases and Human Health of Sichuan Prov

[2] 全球食源性疾病现状 [J].

刘秀英 .

国外医学(卫生学分册), 2003, (04) :199-205

[3] 变形杆菌基因分型方法的评价 [J].

贾宁 ;

林茂虎 ;

陈世平 ;

索继江 ;

邢玉斌 ;

江朝光 .

中华医院感染学杂志, 2002, (09) :15-17

[4]

林业试验设计[M]. 中国林业出版社 , 续九如, 1995

← 1 →