广东番茄曲叶病毒G2分离物基因组DNA-A的分子特征

被引:12
作者
何自福
虞皓
罗方芳
机构
[1] 广东省农业科学院植物保护研究所
基金
广东省自然科学基金;
关键词
广东番茄曲叶病毒; DNA-A; 序列分析; 分子特征;
D O I
10.13343/j.cnki.wsxb.2005.01.012
中图分类号
S432.4 [侵(传)染性病害];
学科分类号
摘要
从采集于广东的番茄曲叶病病株上分离到病毒分离物G2 ,序列分析结果表明 ,其DNAA为单链环状 ,全长2 74 4nt,共有 6个ORF ,其中病毒链上编码AV1(CP)、AV2 ,互补链上编码AC1、AC2、AC3和AC4。BLAST结果显示 ,与G2基因组有同源关系的病毒均属双生病毒科菜豆金色花叶病毒属。序列比较结果显示 ,G2与菜豆金色花叶病毒属病毒的DNAA序列同源率均不超过 83% ,其中同源率最高的是PaLCuCNV[G10 ](82 8% )。进一步比较发现 ,它们的基因间隔区 (IR)变异最大 (同源率为 30 9%~ 81 8% ) ;CP氨基酸序列的同源率较高 (77 6 %~ 99 2 % ) ,AC4蛋白氨基酸序列的同源率较低 (4 3 5 %~ 78 8% )。系统进化关系分析结果也显示 ,G2与已报道的菜豆金色花叶病毒属病毒的亲缘关系均较远。因此 ,G2可能是双生病毒科菜豆金色花叶病毒属中一个未报道的新种 ,命名为广东番茄曲叶病毒 (TomatoleafcurlGuangdongVirus ,ToLCGDV)
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