普通油茶泛素结合酶UBE2-J2的cDNA序列及蛋白质结构分析

被引：6

作者：

林萍 ^{[1
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姚小华 ^{[1
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曹永庆 ^{[1
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龙伟 ^{[1
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王开良 ^{[1
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滕建华 ^{[2
]}

机构：

[1] 中国林业科学研究院亚热带林业研究所

[2] 浙江省金华市东方红林场

来源：

林业科学研究 | 2013年 / 26卷 / 06期

关键词：

普通油茶; 泛素结合酶; Solexa测序; 生物信息学;

D O I：

暂无

中图分类号：

S794.4 [油茶];

学科分类号：

090702 [森林培育];

摘要：

泛素结合酶(E2)是泛素/26S蛋白酶体途径中3个关键酶之一,在靶蛋白识别、与泛素连接酶(E3)互作等蛋白的泛素依赖性水解和N-末端规则依赖性水解途径的关键环节中起重要作用。采用Solexa测序技术获得了1条普通油茶E2的全长cDNA序列,命名为UBE2-J2,该基因编码239AA,与其它物种的E2具有较高的一致性和相似性;同源建模的结果表明:普通油茶UBE2-J2蛋白具有泛素结合酶催化位点(UBCc),第8 122位氨基酸碱基为其泛素结合酶基因家族的保守区域,第75 122位氨基酸残基区域中有17个可与泛素形成硫酯键中间产物的残基,其中,87位的半胱氨酸残基是该酶活性中心位点,另有5个残基是与E3酶相互作用的位点。UBE2-J2具有C端延伸结构,故普通油茶UBE2-J2蛋白属于II类E2基因家族成员。

引用

页码：744 / 751

页数：8

共 16 条

[1]

油茶泛素结合酶E2基因全长cDNA克隆及其RNAi干扰载体的构建 [D].