刚地弓形虫磷酸甘油酸酯变位酶2基因编码蛋白主要特性与抗原表位的生物信息学分析

被引：16

作者：

王芬 ^{[1
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王海龙 ^{[1
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殷丽天 ^{[2
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孟晓丽 ^{[1
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刘红丽 ^{[1
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殷国荣 ^{[1
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机构：

[1] 山西医科大学医学寄生虫学研究所寄生虫学教研室

[2] 山西医科大学生理学系细胞生理学省部共建教育部重点实验室

来源：

中国病原生物学杂志 | 2010年 / 5卷 / 11期

关键词：

刚地弓形虫; 磷酸甘油酸酯变位酶2; 生物信息学; 抗原表位; 免疫原性;

D O I：

10.13350/j.cjpb.2010.11.010

中图分类号：

R392 [医学免疫学];

学科分类号：

100108 [医学免疫学];

摘要：

目的从生物信息学角度分析刚地弓形虫磷酸甘油酸酯变位酶2(TgPGAM2)基因编码蛋白的结构与抗原表位,预测该蛋白的免疫原性。方法利用蛋白分析专家系统(ExPASy)提供的ProtParam、SOSUI、TMHMM、HNN、MotifScan,NCBI上的ORF finder、SignalP、Bcepred等生物信息学在线分析程序,结合Gene Runner、DNAMAN等生物信息学软件,分析、预测TgPGAM2蛋白的理化性质、可溶性、表面可及性?可塑性,信号肽,跨膜区,翻译后修饰位点、亲(疏)水性、二级结构、抗原表位等。结果该蛋白由264个氨基酸组成,分子式为C1345H2097N363O385S11,分子质量为29.865 3 ku,等电点理论值为6.46,波长280 nm时的吸光度(A)值为1.697,半衰期为30 h,有10个表面可及性参数≥1.9的区域、3个亲水性参数得分≥1.9的区域、3个柔韧性参数得分≥2的区域、8个翻译后修饰位点、16个潜在抗原表位,为可溶性表达蛋白。结论刚地弓形虫PGAM2基因编码的Tg PGAM2为可溶性蛋白,具有免疫原性,可作为弓形虫病疫苗候选抗原。

引用

页码：840 / 843

页数：4

共 3 条

[1]

植物水溶性蔗糖合成酶生物信息学分析初探 [J].