河南省艾滋病毒I型膜蛋白基因序列特征和亚型研究

被引:4
作者
崔为国
邢辉
王哲
黄海龙
李宏
薛晓玲
朱新朋
邵一鸣
机构
[1] 河南省疾病预防控制中心
[2] 中国疾病预防控制中心
[3] 中国疾病预防控制中心 河南郑州
[4] 中国北京
[5] 河南郑州
关键词
人类免疫缺陷病毒Ⅰ型; 亚型; 序列测定; 基因变异;
D O I
10.13515/j.cnki.hnjpm.2005.01.002
中图分类号
R373 [人体病毒学(致病病毒)];
学科分类号
100103 ; 100705 ;
摘要
目的 了解在河南省流行的人类免疫缺陷病毒(HIV)毒株的流行情况及亚型特征。方法 用套式聚合酶反应(nested -PCR)对28份河南省内的HIV-1感染者外周血单个核细胞(PBMc)中的膜蛋白基因进行扩增,并对C2-V3及其邻区350 -450个核苷序列进行测定和分析。结果 28份样品间的基因离散率为5.72%,与流行于云南的(泰国B)毒株基因离散率 为5.80%,与其它国际亚型,欧美B、A、C、D、F、G、H、J、O亚型基因离散率均在18.05%以上。系统树分析显示,28份毒株与 泰国B亚型聚在一起而远离其它国际亚型。其毒株V3环四肽序列泰国B亚型基因型GPGQ8例占28.57%,欧美B亚型基 因型GPGR13例占46.43%.结论 河南省流行的HIV株属B′亚型,其毒株来自与泰国接壤的云南,在河南流行的时间约在 6~10年,其V3环顶端四肽序列特征以GPGR为主。
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