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湖北省HIV-1流行毒株的基因序列测定和亚型分析
被引:17
作者:
李允文
邵一鸣
罗小光
苏玲
张流波
陈均
方越
袁健中
张艺
陈惠萍
JosefKostler
HansWolf
机构:
[1] 湖北省卫生防疫站,中国预防医学科学院病毒所艾滋病参比实验室,德国累根斯堡大学医学微生物学研究所
来源:
关键词:
HIV-1,亚型,基因变异,序列测定;
D O I:
暂无
中图分类号:
R512.91 [获得性免疫缺陷综合征(AIDS艾滋病)];
学科分类号:
摘要:
1996年8月下旬采集20份湖北省HIV 1感染者外周血,分离单个核细胞(PBMCs)提取核酸使用PCR进行扩增获得HIV 1膜蛋白(env)基因的核酸片段,并对其C2 V3及邻区350~450个核苷酸序列进行了测定和分析。研究结果表明,这20份样品均为B亚型的HIV 1毒株序列,彼此间的基因离散率为1.9%。与国际A E亚型参考序列及部分地区B亚型代表株序列相比较,湖北的20个毒株与流行与我国云南德宏、四川和河南等地的B亚型毒株序列十分接近,均属于泰国B亚型;它们的基因离散率在1.9%~3.2%的范围内。根据以上数据及其它资料提示,HIV 1在湖北的流行时间不长,该流行区毒株的传入与流行在云南德宏州的相同亚型HIV 1毒株密切相关。
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