尾叶桉GLU4无性系肉桂酰乙醇脱氢酶基因克隆及序列分析

被引:5
作者
陈博雯 [1 ]
蒋华 [2 ]
覃鹏飞 [3 ]
姜伟 [4 ]
机构
[1] 广西优良用材林资源培育重点实验室,广西林业科学研究院
[2] 广西国有维都林场
[3] 广西国有大桂山林场
[4] 广西大学生命科学与技术学院
关键词
尾叶桉; 肉桂酰乙醇脱氢酶; 木质素合成; 基因克隆; 序列; 生物信息学分析;
D O I
10.16473/j.cnki.xblykx1972.2014.02.012
中图分类号
S792.39 [桉];
学科分类号
摘要
根据植物中CAD基因保守序列设计引物,以尾叶桉GLU4嫩茎为材料克隆到其CAD基因,命名为EuCAD。序列分析结果表明,该基因gDNA长2 200 bp,cDNA长1 102 bp,开放阅读区编码356个氨基酸。EuCAD编码的蛋白质序列分析显示,序列中具有完整CAD1保守结构域,并包含NADP结合位点以及2个Zn结合位点。同源性分析结果显示,EuCAD核酸序列与其他5种桉属植物CAD基因同源性达到97%以上,EuCAD编码蛋白与碧桃等植物中CAD蛋白同源性也在79%以上。对EuCAD编码蛋白进行理化性质及结构的生物信息学分析结果显示,该蛋白为一种无信号肽、无跨膜区的酸性蛋白质,二级结构包含典型的α-螺旋和β-折叠,三级结构同源建模显示与拟南芥的AtCAD4同源性极高。系统进化树分析结果显示,该蛋白与桉属、杨属植物亲缘关系较近,与杉科植物较远。
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