三种农田土壤中氨氧化细菌amoA基因多样性比较分析

被引：8

作者：

汪峰 ^{[1
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曲浩丽 ^{[1
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丁玉芳 ^{[1
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孙波 ^{[3
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崔中利 ^{[1
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曹慧 ^{[1
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机构：

[1] 南京农业大学农业部农业环境微生物工程重点开放实验室

[2] 南京农业大学资源与环境科学学院

[3] 中国科学院南京土壤研究所

[4] 不详

来源：

土壤学报 | 2012年 / 49卷 / 02期

关键词：

氨氧化细菌; amoA基因; RFLP分析; 农田土壤; 微生物多样性;

D O I：

暂无

中图分类号：

S154.3 [土壤微生物学];

学科分类号：

摘要：

比较分析中国东部不同季风气候区中海伦黑土(HL)、封丘潮土(FQ)和鹰潭红壤(YT)3种土壤氨氧化细菌amoA基因多样性。采用非培养方法直接从土壤中提取微生物总DNA,用氨氧化细菌amoA基因特异引物扩增总DNA,构建了3种土壤amoA基因文库,并对文库进行限制性长度多态性(RFLP)分析。HL、FQ和YT的amoA基因文库克隆数量分别为49、50和48个,相应的RFLP类型数为10、10和14个OTUs,其中有4个OTUs为三种土壤共有;YT中氨氧化细菌amoA基因多样性指数最高,FQ最低;HL和FQ群落的相似为70%,HL与YT的相似度为50%,而FQ和YT之间仅为42%,说明氨氧化细菌具有地理分布的规律:17个amoA基因序列可以被聚成6个cluster,分属Nitrosospira和Nitrosomonas两个属。三种农田土壤中均存在丰富的氨氧化细菌,表明氨氧化细菌在农田土壤氮素循环中具有重要作用。

引用

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