香蕉根系均一化全长cDNA文库的构建和鉴定

被引：25

作者：

王卓 ^{[1
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殷晓敏 ^{[1
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王家保 ^{[3
]}

徐碧玉 ^{[4
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金志强 ^{[1
,4
]}

机构：

[1] 中国热带农业科学院海口实验站

[2] 海南大学

[3] 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所

[4] 中国热带农业科学院热带生物技术研究所,农业部热带生物技术重点开放实验室

来源：

园艺学报 | 2011年 / 38卷 / 09期

关键词：

香蕉; 根系; 均一化; cDNA文库; 基因; 表达;

D O I：

10.16420/j.issn.0513-353x.2011.09.006

中图分类号：

S668.1 [香蕉];

学科分类号：

090201 [果树学];

摘要：

以香蕉幼苗根系为材料,利用DSN(duplex-specific nuclease)均一化技术与SMART(switching mechanismat5′end of RNA transcript)技术相结合,构建香蕉根系均一化全长cDNA文库。经检测,初级文库滴度1.1×106cfu·mL-1,库容5×106个独立克隆,重组率大于95%,插入片段平均长度大于1kb,表明文库质量较好。随机挑取192个克隆进行EST(expressed sequencetags)测序,成功获得179个高质量EST,含5个conting和174个singlet,冗余度仅为2.35%。小规模测序拼接后获得145个unigenes,对unigenes分析结果表明文库的可靠性好。从序列比对结果中挑选3个与其它植物同源的抗逆基因,利用RT-PCR方法进行了干旱、低温及盐胁迫条件下基因表达分析,结果显示这3个基因在不同的逆境下差异表达。

引用

页码：1667 / 1674

页数：8

共 14 条

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