PCR-RFLP分析桉树人工林土壤微生物的群落结构

被引:16
作者
段思蒙 [1 ,2 ,3 ]
申佩弘 [1 ,2 ,3 ]
潘莉莉 [1 ,2 ,3 ]
李双喜 [1 ,2 ,3 ]
蒋承建 [1 ,2 ,3 ]
武波 [2 ,3 ,4 ]
机构
[1] 广西大学生命科学与技术学院
[2] 微生物及植物遗传工程教育部重点实验室
[3] 广西亚热带生物资源保护利用重点实验室
[4] 广西民族大学化学与生态工程学院
关键词
桉树; 16SrDNA; PCR-RFLP; 群落结构;
D O I
暂无
中图分类号
S714 [森林土壤学];
学科分类号
090301 [土壤学];
摘要
本研究利用限制性内切酶片段长度多态性(RFLP)和16SrDNA序列分析相结合的方法研究了广西南宁高峰林场人工桉树林中土壤微生物的群落结构。通过采用直接法提取桉树人工林土壤中微生物总DNA,构建细菌的l6SrDNA克隆文库,从中随机挑取了192个阳性克隆进行检测,分析显示188个阳性克隆子确定含有16SrDNA并分归为52个不同的类群OTUs,随机挑取其中35个克隆进行测序,并构建了系统发育进化树。研究结果表明:桉树人工林土壤中细菌种类较为丰富,含有大量的未培养微生物,进一步的序列分析表明桉树人工林土壤中占优势的类群分别为A cidobacteria(40%)和Proteobacteria(27%)。本研究对桉树人工林土壤微生物群落结构进行了研究,为进一步研究桉树人工林环境质量变化提供基础资料。
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